El origen de la posta data de 1772, lugar de refugio y aprovisionamiento a los viajeros y mayorales y relevo de la caballada que por su ubicación en la ruta, unía el Virreinato del Río de la Plata con el de Lima. La casona perteneció a Don José Gregorio Álvarez Prado; desde 1810 fue destacamento militar y durante las Guerras de Independencia jugó un papel crucial, transformándose en fortín de avanzada y cuartel del Comandante Manuel Álvarez Prado. En 1813 descansó en ella el General Manuel Belgrano a su regreso de la Campaña al Alto Perú. También pasaron por ella Castelli, González Balcarce, Rondeau, el Gral. Güemes, entre otros.
La colección del Museo está compuesta por elementos arqueológicos pertenecientes a los pueblos originarios de la región (desde 10.000 a.C. hasta el período incaico), armas españolas y criollas del siglo XVI al XIX, medios de transporte utilizados durante la etapa colonial y mobiliario de fines de siglo XIX. En el predio se encuentra también una estación experimental agrícola, la Unidad de Gestión de Quebrada de Humahuaca y una capilla del siglo
XX que sigue las técnicas constructivas y el estilo de las existentes en la Quebrada. En el año 1959 se declara Monumento Histórico Provincial (Dec. Prov. Nº 2058); en el año 2002 fue declarada Lugar Histórico Nacional (Ley Nº
25.574) y en el año 2003 se declara Complejo Cultural a la Finca de Hornillos, con el objeto de preservar, conservar, divulgar y mantener el patrimonio natural, arqueológico e histórico que caracteriza a la Posta de Hornillos.